先其分子式,生产原料,生产工艺都有本质的区别.
这里说下应用方面,建筑涂料、腻子粉方面,羧甲基纤维素钠一般用于普通内墙腻子,羟丙基甲基纤维素用于外墙防水腻子,之前我一直理解为羧甲基纤维素钠用于腻子粉干燥后,遇水会再次溶解,而羟丙基甲基纤维素却不会,这个观点是错误的,在腻子粉方面应用的根本区别是羧甲基纤维素钠与灰钙、白水泥会发生反应生成絮凝状沉淀,但是羟丙基甲基纤维素却不会.羧甲基纤维素钠溶于冷水,而羟丙基甲基纤维素则是分热熔型（即加温溶解）和速溶型,速溶型是可以溶于冷水的,但是常规使用上,大多数用户还是倾向于热熔型,这与使用习惯是密不可分的,所以有非常多的厂家只生成热熔型,就是这个原因.
羟丙基甲基纤维素
（1）羟丙基甲基纤维素易溶于冷水，热水溶解会遇到困难。但它在热水中的凝胶化温度要明显高于甲基纤维素。在冷水中的溶解情况，较甲基纤维素也有大的改善。
（2）羟丙基甲基纤维素的粘度与其分子量的大小有关，分子量大则粘度高。温度同样会影响其粘度，温度升高，粘度下降。但其粘度高温度的影响比甲基纤维素低。其溶液在室温下储存是稳定的。
（3）羟丙基甲基纤维素的保水性取决于其添加量、粘度等，其相同添量下的保水率高于甲基纤维素。
（4）羟丙基甲基纤维素对酸、碱具有稳定性，其水溶液在pH=2~12范围内非常稳定。苛性钠和石灰水，对其性能也没有太大影响，但碱能加快其溶解速度，并对粘度销有提高。羟丙基甲基纤维素对一般盐类具有稳定性，但盐溶液浓度高时，羟丙基甲基纤维素溶液粘度有增高的倾向。
（5）羟丙基甲基纤维素可与水溶性高分子化合物混用而成为均匀、粘度更高的溶液。如聚乙烯醇、淀粉醚、植物胶等。
（6）羟丙基甲基纤维素比甲基纤维素具有更好的抗酶性，其溶液酶降解的可能性低于甲基纤维素。羟丙基甲基纤维素对砂浆施工的粘着性要高于甲基纤维素。
羧甲基纤维素
（1）羧甲基纤维素吸湿性较大，一般条件储存会含有较大水份。
（2）羧甲基纤维素水溶液不会产生凝胶，随温度升高而粘度下降，温度超过50℃时，粘度不可逆。 （3）其稳定性受pH影响较大。一般可用于石膏基砂浆中，不能用于水泥基砂浆中。在高碱性时，会失去粘度。 其保水性远远低于甲基纤维素。对石膏基砂浆有缓凝作用，并降低其强度。但羧甲基纤维素价格明显低于甲基纤维素 这即是羟丙基甲基纤维素 羧甲基纤维素。